孢子作为高爆发输出的舰载机单位，对缺乏防空能力的舰队构成极大威胁。针对孢子的特性，需优先选择具备高效防空能力的舰船，并结合合理的舰队编组策略。防空型护卫舰和搭载防空战机的航母是核心对抗手段，同时需注意舰船的火力配置与阵型安排，确保能快速清除敌方空中单位。
防空型护卫舰中，刺水母防空型和静海防空型是较为实用的选择。刺水母防空型拥有出色的对空火力，能有效拦截孢子机群；静海防空型则凭借较高的命中率，在前期防空作战中表现稳定。雷利亚特隐身型虽以闪避见长，但中排定位使其在对抗孢子时效率略低，需谨慎使用。若拥有红宝石离子炮型，其能量武器能对孢子造成可观伤害，但需注意其直射攻击的局限性。
航母搭载的防空战机是另一关键对抗手段。CV3000和太阳鲸航母可配备林鸮、蜂巢等防空战机，通过载机数量优势压制孢子。需优先强化战机的命中与伤害模块，并确保航母位于舰队后排以避免过早被击毁。若资源有限，可选用载机型721驱逐舰作为过渡，但其防空效率远低于专业载机母舰。
舰队编组时，建议将防空单位分散部署于主力舰队与高速输出队中。主力舰队以前排抗伤舰船（如ST59、奇美拉）吸引火力，中后排配置防空舰船；高速输出队则以静海脉冲型等机动单位侧翼包夹，直接打击敌方航母。需避免将所有防空力量集中于单一舰队，以防被孢子集中突破。
实战中还需关注孢子机的攻击优先级与战斗序列。孢子通常优先攻击大型舰船，因此战列巡洋舰和航母需配备额外护盾或维修支援。通过预判敌方孢子部署方向，可提前布置封锁圈或增援舰队，以多打少降低战损。
根据战局灵活调整防空单位比例，并优先击毁敌方载机平台，方能有效化解孢子威胁。
